判斷結膜炎種類相對比較困難，可根據癥狀大致判斷，如果分泌物以水樣為主，即患者比較喜歡流淚狀態下，則認為病毒感染可能性較大。如果流出來黃色或膿性分泌物，則認為細菌性感染可能性較大。明確具體是細菌感染還是病毒感染，可進行分泌物培養，也可以進行涂片觀察屬于革蘭氏陽性菌還是革蘭氏陰性菌，甚至可以進行涂片明確是否有真菌感染可能。對于急性結膜炎患者，如果水樣分泌物較多，會給予抗病毒為主的藥水滴眼，如頻繁使用更昔洛韋眼用凝膠，同時配合廣譜抗菌眼藥水，如氧氟沙星眼藥水。如果感覺有大量膿性分泌物，并且發生于新生兒，應先考慮淋球菌感染。此時不僅應局部用藥，還需全身靜脈輸注青霉素，出現結膜炎建議患者及時到眼科就診檢查。