手術時在麻醉狀態下不會感覺疼痛，但術后會有疼痛感，因麻醉后刀口在，肯定有點疼，但現在都追求無痛治療，術后常規用口服或針劑鎮痛。疼痛并不是很可怕問題，基本上能耐受。疼與病人的個人耐受程度有關，醫學上疼痛的痛閾每人不同，不管痛閾高還是痛閾低，通過鎮痛手段可解決此問題。 術后疼痛主要原因與排便有關，在排便時因切口有撕裂、括約肌有擴張收縮，可引起疼痛不適感，此情況通過溫水坐浴或中藥坐浴可解決。另外疼痛輕重與手術切口有關系，如單純黏膜脫垂，在直腸齒線以上切口，基本沒有明顯疼痛的感覺，疼痛感覺主要是肛周切口引起，因單純直腸前突手術做的少一些，一般附帶把痔瘡、黏膜脫垂一并處理。 單純直腸前突手術，因切口主要在齒線以上，此手術不會特別疼，因齒線以上無感覺神經，可能會有點墜脹不適感覺，但不會特別疼。但常規手術黏膜脫垂附帶處理痔瘡，特別是外痔，因肛周有切口，肛周神經末梢比較豐富痛覺很敏感，因此處理外痔切口比較疼。