大多數患者卵圓孔未閉都不會出現明顯癥狀，因為心臟內血流分流量較少。但在劇烈運動、咳嗽、潛水時，可能會導致右心房壓力超過左心房，此時可以通過未閉的卵圓孔出現明顯的右向左分流。 分流可能是在干預影響下出現的短暫現象，也可能持續存在，從而出現相應癥狀，如腦卒中、偏頭痛、減壓病等。類似癥狀一般好發于成年人以及少部分青少年，但在兒童期較為少見。