多數兒童吃轉移因子，不存在副作用。轉移因子是一種比較安全的調節免疫力的藥物，只有極少數過敏體質的兒童，吃轉移因子可能會出現過敏癥狀，比如孩子在服藥期間，身上可能會長紅斑或者出現充血疹，導致濕疹加重或者引起蕁麻疹，一般在停藥后，皮疹會逐漸減輕和消失。當孩子有細菌或者病毒感染時，可以輔助性地應用轉移因子，提高孩子的免疫功能，加速疾病的愈合。此外，對于存在有免疫功能低下或者反復呼吸道感染的患者，可以適當口服轉移因子調節免疫功能，改善機體的免疫狀況，加快疾病愈合。