流產不干凈可能會導致的后遺癥如下：1、貧血：胚物殘留會影響子宮的收縮，表現為流產后的陰道出血的量和出血時間的延長，出血過多，甚至導致貧血；2、感染：胚物組織殘留在宮腔內時間過長，可能會導致宮腔內的感染，導致子宮內膜炎的發生，也有可能會誘發宮腔粘連。如果感染沒有控制好，通過宮腔蔓延到盆腔會導致慢性盆腔炎，比如輸卵管炎，輸卵管積水，甚至慢性盆腔痛；3、不孕；4、宮外孕。因此流產之后，如果出現陰道出血時間長于2周或出血量明顯多于月經量，需要及時到醫院復查，以除外宮腔殘留的風險，并且及時予以處理。最關鍵的預防措施，是盡量不要做沒有指征的人工流產或藥物流產。