試管嬰兒打肝素的用處有兩個：第一、預防和治療妊娠期血栓性疾病的發生；第二、預防和降低流產，提高輔助生殖的成功率。不是所有的輔助生殖即試管嬰兒，在胚胎移植以后一定要打肝素。打肝素有適應證，主要針對于受移植的個體患有一些免疫性疾病，比如抗磷脂抗體綜合征、遺傳性易栓癥、紅斑狼瘡等免疫疾病。注射肝素的目的是預防血栓性疾病，降低流產的發生率，提高試管嬰兒的成功率，因此在輔助生殖的過程中，選擇應用肝素針不能一概而論，主要看個體是不是有應用肝素治療的適應證。肝素治療的適應證，在輔助生殖中最常見的是某種免疫性疾病，免疫性疾病會導致局部的血栓性疾病的生成、形成，血栓性疾病的生成，會影響子宮內膜的容受性和子宮內膜對于胚胎組織血液的供應，會導致胚胎發育停止，甚至流產等現象。最常見的是抗磷脂抗體綜合征、遺傳性易栓癥、部分免疫性疾病。