卵巢囊腫多數情況做完手術可以好，但由于部分囊腫容易復發，因此即使術后恢復也應定期進行復查，如惡性腫瘤，或巧克力囊腫，則依舊需要通過后續用藥，來防止復發。卵巢囊腫分為多種，多數卵巢囊腫做完手術后算徹底治愈，但部分卵巢腫物，如卵巢巧克力囊腫復發率高，如果術后不用藥可能復發率2年即可達到40%左右，因此巧克力囊腫患者術后依舊需要常規用藥，如GnRH-a至少需用藥6個月，之后如果不準備生育，可以繼續服用短效口服避孕藥，或高效孕激素來預防復發。對于卵巢惡性腫瘤，多數情況下術后需要繼續化療6-8個療程，避免復發。對于期別比較晚的患者，化療后還需要通過服用靶向藥物維持治療，以避免復發。另外，即使不是惡性腫瘤、巧克力囊腫，其他的畸胎瘤，或卵巢的交界性腫瘤同樣容易在術后數年，甚至幾十年后復發，因此建議患者應每年定期進行年度體檢。