新生兒梅毒抗體也會轉陰。新生兒出生后沒有其它異常體征，且化驗血清學檢測梅毒抗體，也就是TPPA陽性，但非梅毒螺旋體RPR陰性或者RPR滴度低于母親產前滴度4倍以內，這時不完全確認新生兒到底是否為先天性梅毒，也就是新生兒得不得先天性梅毒現在無法確認。此時新生兒出生后可能攜帶有母體內梅毒抗體陽性的結果，隨著生長發育，隨著時間流逝，抗體可以被血液稀釋，可以逐漸消失，因此新生兒梅毒抗體也會轉陰。 如果抗體轉陰，也就是TPPA轉陰，從而也排除新生兒先天性梅毒的診斷。目前來看，只有新生兒TPPA可能轉陰，對于大多數后天獲得性梅毒而言，TPPA是終身攜帶，通常不消失。