藥物流產過程大約為3天，前2天會給患者吃米非司酮，可以起到殺滅胚胎作用。在第3天早上時，要求患者到醫院將米索前列醇空腹服下。當吃藥后排出子宮腔內孕囊，醫生檢查后確定是妊娠物，患者多可以回家，同時醫生會開具一些藥物促進宮腔內其它蛻膜或血塊排出。 所以，藥物流產基本服藥過程是3天，但有時患者吃第一次藥物后，可能妊娠物無法排出。經過6小時后，醫生會讓患者服用第二次藥物，并且可能會讓患者回家觀察。若有組織物排出，則需要帶著排出組織物到醫院由醫生進行檢查。此外，服用藥物之后可能會有出血過程，但一般不超過2周。