繼發性腎小球腎炎的臨床診斷主要考慮可以引起繼發性腎小球腎炎的原因，患者需要完善相關檢查。例如需要考慮高血壓引起腎損傷，需要監測血壓變化，即監測24小時動態血壓，檢查患者是否存在高血壓引起的眼底損傷間接判斷腎臟損傷。糖尿病腎病引起繼發性損傷需要監測血糖變化，檢測患者眼底病變、監測尿微量蛋白變化判斷是否存在糖尿病損傷。若判斷患者是否存在乙肝、丙肝等傳染性疾病引起腎損傷，需要進行術前免疫檢測，即乙肝、丙肝、艾滋病、梅毒等相關性檢測。 若為排除系統性紅斑狼瘡、干燥綜合征、類風濕等風濕性疾病引起繼發性腎損傷，需要排查抗核抗體、抗雙鏈DNA等風濕系列檢查，稱為抗ENA譜檢測。排除梗阻性腎病等因素造成腎損傷需要進行泌尿系超聲檢查，排除腫瘤相關性疾病導致腎損傷需要檢查腫瘤標志物、CT等。