淺表器官B超可以檢查很多結構，包括甲狀腺、乳腺、淺表淋巴結、涎腺，在男性中還可以檢查陰囊內結構。以甲狀腺為例，可以觀察甲狀腺的彌漫性病變和局灶性病變，彌漫性病變包括單純性的甲狀腺腫即大脖子病，以及橋本甲狀腺炎，是一種炎癥，或者是Graves病即甲亢，彌漫性病變還包括亞急性甲狀腺炎等病變。而局灶性的病變包括良性的和惡性的，良性的有結節性甲狀腺腫，在體積比較大時，除了診斷，還可以引導進行消融治療。對于惡性的病變，超聲診斷的準確性比較高，對于一些非常小的病變，也能夠檢測得出來。對于1cm以下的、低微的甲狀腺乳頭狀癌，可以進行超聲引導下的消融治療。此外超聲還可以檢查淺表淋巴結，包括頸部、腋窩、腹股溝等不同區域的淺表淋巴結。女性還可以檢查乳腺有沒有炎癥，有沒有良性或者惡性腫瘤，男性可以檢查睪丸有沒有病變、有沒有扭轉、精索靜脈是否有曲張等。