良性腫瘤會做免疫組化，只是相對做得比較少，比如脂肪瘤，如果在普通常規病理檢查已經能夠明確的時候，不需要再做免疫組化檢查。而如果發現病變，普通常規HE檢查不能夠非常明確給出病理診斷的時候，需要做免疫組化檢查。 免疫組化的檢查是一種特異方法，像鑰匙和鎖相配對一樣，通過免疫組化方法進行配對，明確來源于什么細胞，比如梭形細胞病變有很多種來源，可以來源于脂肪、血管、神經，還可以來源于間質病變，用普通HE檢查往往不能夠明確，必須要用免疫組化。比如CD34陽性可以明確血管來源，考慮是血管源性腫瘤。SMA陽性是平滑肌源性病變，考慮是不是肌源性腫瘤。CD117陽性是間質瘤來源的病變。所以免疫組化檢查可以幫助判斷來源，即良性病變里面，也有通過普通HE檢查不能夠明確，還是需要做免疫組化幫助明確診斷。另外，Ki-67是增殖指數，不能夠幫判斷是什么來源，但是可以告訴病變的活性是多少，即細胞增長的速度快不快，對于提示病變惡性程度也有意義，所以免疫組化可以在良性病變中應用。