胃黏膜損傷絕大多數可以自愈。其損傷包括各種因素，有機械性損傷，如異物刺激、扎傷，或者取活檢造成的醫源性損傷，多半都可自愈，有時會用黏膜保護劑、質子泵抑制劑、抑制胃酸的藥物來幫助愈合。另外，像燙傷、直接食物刺激、HP感染引起的炎癥性損傷，也可以自愈。HP感染引起的炎癥性糜爛潰瘍也屬于胃黏膜損傷的表現，有一些可以治愈，存在自愈周期，有一些可能會持續存在，形成慢性的糜爛潰瘍。此時需要用藥物治療，尤其對根除幽門螺桿菌進行治療。因為反復存在幽門螺桿菌，即使潰瘍治愈之后仍可能再次發作。因此，需根除幽門螺桿菌，同時應用抑制胃酸和保護胃黏膜的藥，才能夠根治潰瘍。