腰上打孔取結石，多數情況下對腎臟損害較小，在特殊情況下，可能會對腎臟造成一定損害。腰上打孔取結石，臨床上稱為經皮腎鏡碎石取石術，手術的指征通常是＞2cm的結石或多發結石，再者結石較堅硬，用軟鏡、鈥激光碎石難以取到的部位，會考慮打孔取石。雖然腰上打孔屬于微創手術，但是要在經過皮膚、肌肉、腎實質打通道，進入到腎臟中，腎單位會存在一定損失。手術都要權衡利弊。在必須情況下損失一定腎單位，可快速、有效、徹底清石，腎臟通道還會逐漸愈合，愈合后損害比較輕微。如果結石體積較大，需要打多通道，也就是打2-3個孔以上，對腎臟損害較大，患者要權衡上述做法的必要性，保證對側腎臟功能基本正常，才能采用多通道碎石。如果只有孤立腎，一次性打多個通道，腎臟恢復起來可能會有一定困難。在日常生活中要注意預防結石，多喝水，注意部分食物，例如含草酸高、含尿酸高的食物，盡量少吃，才能避免結石快速增大、變多。大多數患者如果使用輸尿管軟鏡碎石，通常不選擇經皮腎鏡碎石取石術。