針灸后頭疼有以下原因：1、針刺的后遺感：臨床常見。即是在針刺的過程中，醫生會盡量要求在針刺部位出現得氣的感覺，即患者表現出來的酸、麻、脹、沉重、疼痛等感覺，這些都是得氣的表現，也稱為經絡之氣的感應，這是在臨床上起到療效的基礎。所以在針刺的過程中，要求盡量要出現得氣的反應，在出完針后，因為部分患者的個人體質原因，可能會出現針刺后遺感，即會遺留有局部的不適癥狀，如酸、麻、脹、疼以及頭疼的癥狀。出現這種情況，患者休息后，局部可以輕微熱敷，可以自行緩解，持續時間不會太久；2、原發疾病：還可能與原發病有關，如有部分頭疼或頸椎病的病人，可能會局部會出現頭疼，即針刺后可能頭疼不會較快緩解；3、針灸的意外：可能是否出現有新的原發病，針灸的過程只要是嚴格按照規范去操作，基本上不會出現大的損害導致頭疼，所以具體問題需具體看，如果出現經過休息后不緩解的情況，建議及時就醫。