通常情況下，丹鱉膠囊對于某些類型的卵巢囊腫有治療作用。丹鱉膠囊具有活血化瘀、軟堅散結的作用，對于炎癥性的卵巢囊腫可以促進炎癥吸收，甚至部分患者服用幾個療程后，可達到卵巢囊腫縮小，甚至消失的效果。而部分類型的卵巢囊腫，可能服用丹鱉膠囊的效果并不明顯，如巧克力囊腫。巧克力囊腫其實是子宮內膜異位癥所形成，異位的子宮內膜跑到卵巢附近，隨每次月經周期的子宮內膜脫落，異位的子宮內膜同樣也會出血，久而久之在卵巢附近便會形成血腫，由于其顏色類似巧克力，因此被稱為巧克力囊腫。此類患者服用丹鱉膠囊，可以改善痛經，或月經過多的癥狀，但想消除囊腫比較困難。