傷口如果出現比較大的創傷，不建議用阿莫西林膠囊直接敷在上面。如果傷口比較淺，沒有暴露真皮層、皮下組織，用云南白藥或普通藥水處理即可。但阿莫西林是粉末狀，也是一種異物，灑在傷口上會嵌在里面，且組織吸收較慢，會形成局部的疤痕包裹，形成包痂。特別深的傷口放入阿莫西林粉末后，是造成了異物的感染，形成的疤痕比較大。應用阿莫西林粉末處理傷口，僅在醫療條件較差，無雙氧水或酒精等，較良好可清理傷口的情況下，防止淺表細菌，如金葡菌、表皮葡萄球菌、鏈球菌的感染。一般不推薦使用阿莫西林處理傷口。