斜視會遺傳，目前斜視的發病原因尚未明確，但斜視的遺傳因素是不容忽視的病因。臨床上可以見到，在一個家系中，會有很多類似的斜視患者，或在雙胞胎身上可以有相同類型的斜視出現，都說明斜視具有一定的遺傳性。部分具有典型的遺傳特性斜視患者，還有明確的致病基因突變，比如先天性眼外肌纖維化的患者，常見的致病基因有KIF21A基因、PHOX2A基因等，在家系當中可以呈現常染色體顯性遺傳的特點。遺傳性的斜視病人，可能并不是斜視本身遺傳，而是引起斜視的誘因可以有一定的遺傳性，如完全調節性內斜視的患者，此家族當中的遠視會遺傳，遠視會導致內斜視的發生。如果遠視沒有被及時糾正，患者就會表現出調節性內斜視的臨床癥狀，這部分遺傳性斜視病人，預防比治療更重要。