基底節和腦干是腦部不同的結構，因此這兩個不同的部位出血時會有不同的表現。基底節區分布著很多密集的核團。如果受到出血的損害，病人會出現有偏側疼痛、偏側癱瘓癥狀。腦干是人生命的重要中樞，分布到顱腦的神經，以及管理的呼吸和心跳的中樞。因此，腦干的出血癥狀十分兇險，病人可能會有呼吸和心跳的驟停，意識障礙等嚴重情況，輕的病人也可能會出現半側或者四肢的無力。從疾病的嚴重程度上來說，腦干出血更加兇險。