苯扎氯銨溶液主要起到皮膚消毒的作用，通常用于手術前的消毒，可以用于黏膜和傷口的消毒。苯扎氯銨溶液的主要有效成分是苯扎氯銨，苯扎氯銨屬于陽離子表面活性劑，對于病原菌起到殺菌的活性，通過改變病原菌細胞膜的通透性，從而使細胞內容物外漏，起到殺菌的作用。此藥物對革蘭氏陽性菌，具有比較明顯的抗菌作用，而對于綠膿桿菌、抗酸桿菌，以及芽孢，則沒有明顯的抗菌活性，主要外用于皮膚的消毒。在使用此藥物時需要注意，在低溫的環境中苯扎氯銨溶液，可能會發生渾濁的情況，這時可以在溫水中進行緩慢加熱，搖勻之后便可以使用。