口腔起水泡通常需要根據原因進行治療，具體如下：1、皰疹、感染：口腔起水泡，若是小水泡，在口腔上一般見于皰疹、感染。如復發性皰疹，常發生在牙齦，出現成簇的小水泡，可應用抗病毒治療，因較明確是單純皰疹病毒感染所引起，可選用口服阿昔洛韋、噴昔洛韋，或局部涂抹阿昔洛韋或噴昔洛韋；2、黏液腺囊腫：較常見的是黏液腺囊腫，在頰黏膜、唇黏膜、舌、舌黏膜的腹部有較多唾液腺，這些唾液腺堵塞后，就形成黏液腺的囊腫。這些黏液腺的囊腫可用手術方法、激光方法或局部打碘酊的方法進行切除或破壞，使黏液腺的囊腫好轉；3、皮膚黏膜病：較為少見的是亮泡、水泡，可發生在牙齦，可能發生在頰黏膜，為口腔黏膜常見的大皰性疾病，或稱為自身免疫性大皰性疾病，為一種皮膚黏膜病。起亮泡的可以是天皰瘡，亦可以是黏膜類天皰瘡，一般易發生在摩擦部位，水泡較大，如部分天皰瘡的泡較快破裂，就會形成黏膜上的一些裂痕。若出現此類情況，患者應到口腔醫院黏膜科就診，需進行組織病理檢查、免疫病理的檢查才能確診，確診后，應選用局部或全身的糖皮質激素治療。