懷孕不可以艾灸肚子，尤其孕期前三個月。懷孕時胎兒剛好位于腹部的位置，艾灸肚子亦引起胎動，子宮產生宮縮可能導致先兆流產。孕婦可選擇遠端的穴位，如四肢的穴位進行艾灸治療疾病，如出現胃疼、惡心、嘔吐等癥狀時，可艾灸足三里、內關等穴位。艾灸本身含有揮發油，亦產生較濃烈的氣味，孕婦常待在艾灸館里或經常使用艾灸，長時間嗅到這種氣味易產生不利影響，但可偶爾進行艾灸。艾灸為一種良好的保健治療方法，但在某些特殊時期及特殊的部位，需避免使用，可能造成不良影響。