男孩出現小便疼痛，通常有以下幾種原因：1、尿道感染：通常尿液經過尿道時，如果有明顯的尿道損傷，細菌容易從尿道口進入到尿道種植感染，嚴重時可導致尿道局部黏膜出現破潰，排尿是容易出現明顯的尿痛；2、包皮、包莖感染：部分男孩可能由于包莖嚴重，包皮口容易形成腫塊樣改變，導致排尿不通暢，長期出現尿垢形成在包皮內，從而阻塞尿道，出現排尿疼痛感。如果有細菌進入包皮，容易產生局部包皮龜頭炎，甚至出現局部包皮膿腫，有時尿道口還會出現分泌物，此時通常排便時容易出現疼痛癥狀。如果出現明顯小便疼痛，但沒有出現包皮紅腫，多半存在尿道感染，通常檢查尿常規明確尿道感染程度，從而使用廣譜抗生素，如頭孢類藥物進行治療，可以達到明顯的緩解效果。但也有部分男孩尿道包皮口有明顯紅腫，通常需要到醫院進行抗炎治療，同時將明顯的包皮膿腫擠破，將膿液排出，則大部分的排便痛的癥狀可以明顯緩解。