久服黃連素會有副作用，具體如下： 1、造成腸道菌群失調，造成消化不良； 2、造成腸道對營養吸收的障礙； 3、同時可能對腸內的酸堿度有一定影響； 4、有些患者服用黃連素以后會有便秘表現。 黃連素還是非常好的藥，目前發現對于血糖、心臟都有一定的好處，但是一定要記住其有抗菌作用，因此絕對不能常吃。黃連素片常用于治療腸道感染的藥物，療效非常肯定，最早期還有人認為其能夠治療胃潰瘍，因為可能對幽門螺桿菌是有一定殺滅作用。但是因為是抗菌素，因此在服用的時候要中病即止，即治療療程結束就不要再吃。