臨床上一般兩次尿培養需要間隔的時間并沒有嚴格規定，常是2-3天內連續進行尿培養，如今日1次，次日清晨1次，后日再留1次，只需間隔24小時即可。此外，尿培養還可間隔3天左右或間隔1周。若患者住院時間不長，但需檢測是否出現尿路感染以及確認病原微生物的種類，通常間隔2-3天進行一次尿培養。正常情況下，尿液中并不存在細菌，如果尿培養出現菌落計數>10^5的大腸埃希菌，則說明存在菌尿的可能。但是一次尿培養的結果有時可因尿液污染而出現假陽性情況，進而導致檢查結果異常，因此需要兩次不同時段的尿培養結果。如果兩次不同時間段取的中段尿尿培養結果一致，且為同一個菌株，一般準確性可達95%以上，即尿液中存在細菌生長。