到目前為止，卵巢局部囊腫的病因尚不清楚，可根據囊腫的大小以及出現的相應臨床癥狀，給予具體的治療。一般小的囊腫在臨床上通常沒有癥狀，隨著囊腫增大，有可能會出現患側下腹部疼痛，還有可能會導致月經紊亂等。如果直徑＞5cm的情況下，可以考慮手術治療。對于生育年齡的女性，通常建議做囊腫的剔除手術治療，保留卵巢繼續發揮功能，可以周期性分泌雌激素和孕激素、排卵等。如果直徑沒有＞5cm，臨床癥狀又不是很明顯的情況下，建議動態觀察，每半年做1次B超檢查，了解囊腫的生長情況。如果生長速度加快，懷疑有惡性變的情況下，要積極考慮手術治療，并且在術前可以考慮做婦科腫瘤標志物的化驗檢查。如果癌胚抗原、癌腫抗原出現異常升高，很可能已經發生惡性變，建議盡快考慮手術治療。