化療出現中途停止的主要危害，是可能會帶來腫瘤治療方面的影響。隨著化療中斷，可能引起腫瘤細胞耐藥，從而再次生長形成腫瘤，由于腫瘤耐藥進展，使疾病進一步加重。此外，患者在此過程中，隨著腫瘤細胞播散，包括血液系統和淋巴系統等，出現由早期到中期再到晚期的形式轉變。涉及到疾病預后，可能受到明顯影響。但臨床上面臨化療中途停止的情況，需要判斷由什么原因導致。部分患者隨著化療藥物反應增加或增大，難以耐受，包括胃腸道反應和骨髓毒性等，如4度骨髓抑制或伴隨相應感染性疾病等，出現此類問題，不得不停用化療藥。主要以糾正副反應為主，一旦機體狀態予以糾正，各項指標恢復時，后續可能會調整方案再繼續用藥。在腫瘤治療上，可能并不會有太大影響。