甲母痣的臨床表現為在甲板出現縱向平行排列的甲黑線，甲黑線排列間距長短規則、顏色均勻，甲黑線可以隨著時間推移逐漸增寬。甲母痣應與甲黑色素瘤進行鑒別，甲黑色素瘤的平行模式不整齊，間距不一、顏色深淺不均，或可在甲板上出現烏斑，伴有甲周浸潤。甲周浸潤時可以在甲周皮膚上出現黑斑，此時不是甲母痣，可能是惡性甲黑色素瘤，需前往醫院進行干預治療。甲母痣與黑色素瘤較大的不同點，在于甲母痣整齊的模式及均勻的顏色。