腦結核是否可以治好取決于發病嚴重程度，疾病越嚴重可能預后越差。此外，還與治療是否及時以及治療是否徹底有關。因為腦結核只有早期及時給予足量、足療程的聯合抗癆治療才可以治好，如果患者已經發病，出現昏迷等情況，通常預后不好。嬰幼兒或老年人患有結核腦膜炎，可能預后會更差。如果經過一段治療以后，患者臨床癥狀、體征已經消失，復查腦脊液、腰椎穿刺等情況下，發現腦脊液細胞計數、糖、氯化物、蛋白質等恢復到正常水平，提示預后較好。