煙曲霉菌肺部感染的臨床表現也像其他肺部感染一樣，有呼吸道的癥狀，咳嗽、咳痰，還可以有咯血、胸痛、喘息等臨床表現，還有全身感染的表現，如發熱、乏力，還可以伴有惡心、嘔吐等消化系統的表現。煙曲霉菌是肺部真菌感染當中比較常見的一種曲霉，除了煙曲霉，還有黃曲霉、黑曲霉、土曲霉，都可以引起肺部感染，一般的肺部感染，都可以有咳嗽、咳痰，無論是曲霉菌還是煙曲霉菌的感染，都可以出現咯血，還可以引起胸痛、喘息，臨床上可以聽到喘鳴音。在影像上有一些曲霉菌感染，有比較特異性的表現，這種感染可以出現結節、暈征，可以形成空洞，空腔可以形成空氣新月征，暈征、空氣新月征是曲霉典型的表現。單純的從癥狀來看，咳嗽、咳痰等表現特異性不強，如果結合影像學，就可能更多的提示是煙曲霉菌感染，如果再結合病原微生物，才能最后確診。如果痰培養取得這種病原，比如支氣管肺泡灌洗，甚至組織學病理學的表現，或者病理發現有曲霉菌，培養出了曲霉，以及查血有曲霉菌的IgG抗體升高，都提示是曲霉菌的感染。在組織里或者肺泡灌洗液深部的標本，培養出來的曲霉菌是確診的標準。