胎兒是否健康與人工授精無關，人工授精從本質上是把丈夫精液留取后，在體外進行優化培養，即用培養液在二氧化碳箱里孵化一段時間，同時還進行洗滌、離心等處理，對精子無害，因此人工授精不會對后代造成影響。女性懷孕本身有機會發生胎兒畸形，尤其是年齡大的女性，因為卵子比較老化，可能造成染色體不分離的情況，年齡大的人，胚胎染色體異常的機會比較多。 不管是人工授精還是自然懷孕，或者做試管嬰兒，孩子畸形的機會都是均等的，不用太過于糾結是不是因為做人工授精導致孩子畸形的發生率增加。任何一個治療不孕的醫生都不會擔保出生的孩子一定沒有問題，發生率和正常懷孕差不多，如果懷孕后按照規定做產前檢查，必要時做產前診斷，完全能確診。