EB病毒感染在人體最常見的感染途徑是口口感染，EB病毒從口腔進入人體，先在咽部的淋巴組織中繁殖，再進入體內淋巴組織中進一步繁殖導致人體發病。人體感染EB病毒通常為隱性感染，自身不會產生異常感覺，由于病毒在體內繁殖，人體會出現EB病毒抗體，在化驗抗體時會發現感染過EB病毒。部分患者感染EB病毒后，會出現咽喉疼痛，稱為咽峽炎，同時伴有發熱、淋巴結腫大、肝功能異常、肝脾腫大，以及皮疹等表現，稱傳染性單核細胞增多癥，這種情況也是EB病毒感染，屬于自限性過程，在對人體造成損傷后，病毒會被人體清，絕大部分患者會痊愈。極少數患者感染EB病毒后，呈現為慢性感染過程，EB病毒此時在人體停留時間超過半年，同時導致人體出現反復發熱、淋巴結腫大、肝功能異常時，此時稱慢性EB病毒感染。慢性EB病毒感染可能與血液疾病有關，包括淋巴瘤、嗜血細胞綜合征等，慢性EB病毒感染通常治療難度比較大。