脾囊腫最好的治療辦法就是做部分的脾切除，囊腫也切除了，脾臟的功能也保留了。但是對于較小的脾囊腫，不主張做手術，而是主張觀察。一般＜5cm的脾囊腫，密切觀察就行了，隔半年到1年做個B超，甚至是CT，看囊腫是否有長大。如果長得較快，或者是超過5cm，建議做手術切除。因為超過5cm的脾囊腫或者長得比較快的脾囊腫，有時不能完全排除是良性或惡性，所以這時做手術較好。在做手術的情況下，則要看囊腫的部位。如果囊腫正好在上級或者下級，做手術就可以選擇囊腫加上上級的脾切除，或者囊腫加上下級的脾切除，既保留了部分的脾臟，手術后脾臟的功能也沒有受到損傷，可以發揮正常的脾臟功能。如果脾囊腫正好在脾底的地方，就是正好在脾臟血管比較豐富的地方，有時做脾臟囊腫的部分脾切除比較困難。在特殊情況下，為了判定囊腫到底是良性，還是惡性，或者囊腫較大，對脾臟影響很大，也可以做脾切除。