病毒性角膜炎主要是抗病毒類的藥物，目前這類藥物的品種還不是太多，比如阿昔洛韋或者更昔洛韋的眼用凝膠。同時也有角膜上皮修復支持和營養的藥，比如玻璃酸鈉、貝復舒(重組牛堿性成纖維細胞生長因子滴眼液)。如果病毒性角膜炎是內皮性或者角膜基質性，角膜的上皮完整時也可以適當用些激素的眼藥水。這種激素的眼藥水主要是抗炎和去水腫，一定要在醫生的監護下使用，還可以點滴保護性藥物和干擾素的眼藥水。病毒性角膜炎對眼睛的損害是反復發作的特點，可能這一段時間好了，過一段時間又發作了，病情遷延不愈。所以需要長期使身體機能保持很壯、很好的狀態，來抵御病毒再復發。同時用藥的時間也比較長一點，比如無環鳥苷或者干擾素的眼藥水點的時間稍微要長一些。發生比較嚴重的病毒性角膜炎時也可以適當口服抗病毒藥物，也能夠起到治療病毒性角膜炎的作用。經過這些綜合的加強身體抵抗力、加強口服的抗病毒藥、加強局部眼睛點藥，一般情況下經過數個月的治療，病毒性角膜炎都能夠得到有效的控制和治好。