心肌肥大的藥物治療要根據病因進行選擇，心肌肥大常見的一些原因，如左心室肥大主要是由于心臟瓣膜性的疾病，造成心臟前后負荷增加，而出現了代償性病變。具體如下：1、主動脈瓣狹窄：如果是主動脈瓣狹窄，主要服用利尿藥物進行相應的治療，如呋塞米、螺內酯、氫氯噻嗪等，可以減少腎臟負荷；2、主動脈瓣關閉不全：如果是主動脈瓣關閉不全引起的，一般可以進行強心利尿治療，口服地高辛、呋塞米、螺內酯等藥物；3、高血壓：如果是高血壓引起的肥厚性心臟病，可以口服氨氯地平、卡托普利等相關降壓藥控制血壓，可以減少心肌的肥厚；4、肺動脈瓣狹窄：如果是右心室肥厚，常見肺動脈瓣狹窄或肺動脈高壓等相關因素而引起的。一般藥物治療無效，可以進行手術治療來改善癥狀，減少心肌肥厚；5、肺動脈高壓：如果是肺動脈高壓引起的，可以吃一些降低肺動脈壓的藥物來進行治療，主要有前列地爾、西地拉非等相關藥物，可以減輕右心室負荷，減少心肌肥厚的發生。因此，心肌肥大藥物一定要根據病因來進行選擇，及時地處理，可以減少心肌肥大的發生和發展。