一般胃鏡檢查沒有副作用，但是畢竟是有創檢查，會有些并發癥，具體如下： 1、主要并發癥是發生咽部不適，也是最容易發生的，因為鏡子經過咽部會對其進行摩擦，因此會造成咽部炎癥或者造成咽部擦傷，一般2-3天時間即可恢復； 2、出血，因為做胃鏡檢查很多情況下需要取活檢，即用鉗子在胃黏膜和食管黏膜上取一塊肉，然后做化驗來確定這病是什么病，以及嚴重到什么程度。取的這塊組織會對黏膜有損傷，也有可能造成出血。另外，做胃鏡時有可能造成創口，如有個比較深的潰瘍，這時候做胃鏡需要注氣，不注氣觀察不到，在注氣過程中有可能造成穿孔。