13價肺炎疫苗是滅活疫苗，對于過敏體質的寶寶應注意過敏反應，常見有皮疹或突然加重的過敏，可以引起喉頭水腫或全身過敏反應，但與寶寶體質發育有關。若寶寶不是過敏體質，過敏幾率較小。打完疫苗嚴重的過敏反應，多數在注射疫苗30分鐘內發生，因此注射疫苗后應該在注射場所觀察30分鐘后再離開。部分寶寶注射疫苗后會出現身體不適，如輕度發熱，通常在注射疫苗當天或第2天，多數為低于38℃的發熱，同時寶寶可能會出現注射局部不適，如局部疼痛、硬腫、硬結。