小兒支原體感染的癥狀分為全身的癥狀和局部的癥狀兩個方面。全身癥狀包括發熱、精神差、食欲不振，局部癥狀包括咳嗽、呼吸異常、呼吸困難。 支原體感染的癥狀為多樣性，有輕有重，咳嗽持續時間可以較長，也可以較短。癥狀輕可以表現為支氣管炎，研究發現支原體感染可以引起上呼吸道感染的癥狀，不一定會發展成肺炎，重者可能有全身多系統損害，包括血小板減少，甚至血栓形成。最常見的癥狀是肺炎，嚴重者甚至引起重癥性肺炎、壞死性肺炎。支原體的特點是沒有細胞壁，比病毒大，比細菌小，所以多數在病毒感染的基礎上合并支原體感染。