超聲介入治療巧克力囊腫無任何副作用，療程短、創傷小，患者恢復較快、體驗感較好。治療療程可根據囊腫大小確定治療次數，例如囊腫較大時可以進行2-3次，每次治療時間20分鐘左右。 超聲波治療較為安全，痛苦小、不易復發，同時屬于一種機械波，不含放射線，與X射線不同，對人體無任何傷害。因此，超聲介入治療屬于無創治療方法，治療時不開刀、不穿刺，患者在接受治療時毫無痛苦。