雙氧水并不適用于所有的中耳炎，對于鼓膜完整、沒有流膿的中耳炎，雙氧水治療效果較差。雙氧水的主要作用是清除膿性分泌物，因此可用于化膿、流膿液的中耳炎患者。 但不建議患者自己在家中使用雙氧水，因為將雙氧水灌到耳朵里后，如果有膿，會不停往外冒泡，患者無法清理這些泡泡。而在耳鼻喉科，醫生可用專業設備、儀器將泡泡清理干凈，然后再將治療的藥水滴進去，達到較好的治療效果。如果不能徹底清除泡泡，反而會產生屏障，導致抗生素藥水無法滴入中耳腔內，無法進行有效治療。 因此，雙氧水可以治療中耳炎，主要用于治療化膿性中耳炎，但是最好在醫院操作，如果患者自己能徹底清理干凈泡泡，也可以用，否則不建議使用。