陰莖上起疙瘩，原因比較多，常見原因如下：1、尖銳濕疣：屬于性病，由于性接觸傳染而來。可以用抗病毒療法或者物理治療，比如冷凍、激光等方法進行處理；2、傳染性軟疣：為半球形小結節，屬于性傳播疾病，自身衛生不潔也可以出現。可以用拔疣的方法處理，有的患者不耐受拔疣，也可以做冷凍、激光等處理；3、疥瘡：與疥瘡感染有關，可以用硫磺軟膏涂抹；4、過敏：可能會出現皮炎濕疹，可以用抗過敏藥物進行治療。