臨床需要從丙肝抗體監測和丙肝核酸監測兩方面，對丙肝進行檢查。對于剛感染的人群，抗體出現的時間通常要晚于核酸檢測的結果。通常感染丙肝病毒后，病毒在體內復制2-3周后即可查到丙肝核酸結果；8-12周即2-3個月，可以查到丙肝抗體。丙肝抗體出現前的時期稱窗口期，即丙肝病毒進入體內可測得抗體出現前的時期。窗口期檢查丙肝抗體呈陰性，但丙肝核酸呈陽性。若存在可疑的感染途徑檢測丙肝，應該先監測丙肝核酸，再監測丙肝抗體。若存在更加可疑的情況，可以同時檢測丙肝抗體和丙肝核酸。若在感染的2-3周內沒有出現丙肝核酸，4周后再復查，同時檢測丙肝抗體和丙肝核酸。