神經官能癥的治療，在臨床上是抗焦慮、抗抑郁的藥物治療。藥物治療的周期，建議服用6-9個月，可能9-12個月，甚至更長，待癥狀逐漸消失以后，再逐漸停藥。突然停藥之后，癥狀可能會反復，還會有藥物的戒斷反應，比如頭暈、無法站穩等癥狀。因此要在癥狀完全消失2-3個月以后逐漸減量，而且需要在專科醫生的指導下進行減量，每1個月減一次。多數病人隨著在專科醫生指導下慢慢減量，也容易實現。有些病人可能伴發失眠的情況，也可能會添加助眠藥物，待睡眠調整以后，再逐漸停藥。