自體脂肪填充是否疼痛取決于手術部位和手術填充的脂肪量。手術操作前會進行麻醉，所以術中不會感受到疼痛。 但在局部麻醉操作下，注射麻醉藥物時會有疼痛感，如果患者對疼痛的耐受性較差，可以考慮進行全身麻醉。但是全身麻醉會增加手術風險，如果填充的脂肪量較小，填充部位較少，局部麻醉能夠起到麻醉效果，則無需進行全身麻醉。