全飛秒手術是通過小切口將角膜中間的基質取出，所以角膜切口小，術后創口愈合較快。此外，因切口少、切斷神經少，所以手術以后出現干眼癥的幾率也比較小。因為角膜沒有被翻起來，只是行微切口，所以手術以后角膜的防護能力較好。 全飛秒手術的缺點是價格比半飛秒手術貴，并且全飛秒手術目前還不能做到個性化，即不能消除角膜不對稱的情況，所以術后不對稱的情況仍然存在。