縱隔子宮屬于子宮畸形的一種，縱隔子宮懷孕主要是在前3個月較危險，因為縱隔子宮有可能會影響受精卵著床，或增加胚胎流產以及胚胎停育發生的風險。通常在12周以后胚胎種植較穩定，縱隔子宮對胚胎生長發育影響相對較小。但還要根據縱隔程度，如果縱隔影響胎兒生長發育，也有可能會導致胎兒宮內生長受限或導致胎位異常，因為縱隔子宮可能會影響胎兒在宮腔內的活動和轉動。在懷孕中期，由于宮腔內空比較大，羊水量比較多且胎兒相對較小，所以在空間內胎兒處于自由活動狀態。而在懷孕晚期，胎兒會固定在縱產勢，大多數都是頭位。但是如果子宮有縱隔，可能會影響胎兒自然轉動，就會導致胎兒在臨產前出現橫位或臀位的情況。所以縱隔子宮對于胎兒生長發育及整個孕期都會有產生影響，在早孕期影響較大且會增加流產和停育風險。