女性甲亢吃藥最常見的副作用就是胃腸道反應，還有轉氨酶升高、白細胞減少、藥物過敏。具體如下：1、胃腸道反應：比如惡心、沒有食欲，因為所有的藥物服用后，首先會到達胃腸道，所以有時可能會有胃腸道的不良反應；2、轉氨酶升高：因為治療甲亢的藥物，不論是丙硫氧嘧啶，還是甲巰咪唑，或多或少個體差異是有人會產生轉氨酶升高或者膽紅素聚集，轉氨酶升高的問題主要見于丙硫氧嘧啶，引起膽紅素問題的主要是甲巰咪唑，但有時甲巰咪唑也會引起轉氨酶升高，包括堿磷酶升高，在使用過程中主要還是和個體差異敏感性非常有關系；3、白細胞減少：也有個體差異，在使用過程中可能會對骨髓有一過性抑制，但如果屬于特別敏感的個體，甚至可能會出現粒缺(粒細胞缺乏癥)，會影響病人伴發嚴重的感染；4、藥物過敏：相對過敏幾率不是很大，但是如果是個體特別敏感的女性，有些患者可能也會有藥物過敏。