肝臟和其它臟器，如骨骼系統、肺臟等在人體內的神經解剖分布不太一樣，扎入針時可能會有點疼痛的感覺，但是一般不會引起劇痛。 而且穿刺活檢的手術操作一般不會直接用穿刺針穿刺人體，而是先通過注射局麻的藥物，使皮膚表面的穿刺點，和經由穿刺的路徑，能通過局麻藥的麻醉達到給患者鎮痛的作用。 肝臟穿刺點位于人體右上腹表面區域，該區域的穿刺路徑很短，一般不會引起患者特別明顯的疼痛感。 另外，肝臟的被膜，即肝臟的表面神經是比較豐富的，所以在這個區間通過良好的麻醉藥注射，運用穿刺針快速通過肝臟被膜操作的手術技巧，可以緩解肝臟穿刺活檢的疼痛感。