孕婦由于其妊娠造成的生理改變，產生的尿路感染有一定的特殊性。早期妊娠，由于懷孕以后體內雌激素、孕激素的變化，比如黃體酮會引起輸尿管蠕動減慢，造成上尿路的尿流減慢。由于生理需求，腎臟會擴大，腎臟的工作也會增加、尿流增加，蠕動緩慢，因此尿潴留在妊娠期會和普通非妊娠期婦女產生差異，這也是孕婦容易出現尿液潴留造成感染的因素。 妊娠后期由于子宮增大壓迫，會引起輸尿管下段和盆壁之間的通路受擠壓，也可引起尿液緩流。產褥期之前，由于子宮增大和下移，入盆后產生的尿路梗阻的機會就會更多。在此基礎上，孕婦容易產生尿路結石，這也是和懷孕相關的危險因素。妊娠中毒癥、高血壓都是加重泌尿系感染的其它因素，因此孕婦感染需要格外關注。孕婦尿路感染的治療過程中涉及到藥物致畸作用，比如對胎兒發育影響，因此在藥物選擇上也有其獨特之處，特別是有些會造成胎兒畸形的藥物要避免應用。