經常頭疼但醫院查不出問題的原因可能是原發性頭痛、緊張性頭痛，也可能是生活習慣不良引起的。
原發性頭痛，如偏頭痛，通常與遺傳因素有關，常在環境、心理等刺激下發作。緊張性頭痛可能是長時間壓力過大、過度緊張等因素引起的，通常不會出現器質性的病變。生活習慣不良，如長時間熬夜、飲食不規律、不注意保暖、缺乏鍛煉等，都可能導致體質下降，從而容易出現頭痛、頭暈、乏力、精神萎靡等癥狀。
此外，也可能是腦血管疾病。比如當患者患有白質疾病或腔隙性腦梗死時，在疾病進展過程中會出現頭痛和頭暈。對于高血壓、糖尿病和動脈硬化患者，頭痛經常發生，需要注意腦血管疾病。此時，建議進行腦部MRI檢查。對于基礎疾病患者，有必要結合頭顱血管的相關檢查，確定頭部本身是否存在器質性病變，如白質變性、腦梗死、腦出血等占位性病變。
以上信息僅供參考，經常頭疼還是建議及時就醫，以醫生的判斷和建議為準。
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